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日本海軍の潜水艦における正式な艦名は『伊号第X潜水艦』『呂号第Y番潜水艦』のような形となるが、ここではゲーム本編中と同様、『伊X』『呂Y』のような省略した形で表記するものとする。

以下、未成艦・未着工艦はxを艦名の後に記す事とする。また、アイテム扱いのものも含め、ゲーム中に実装済みの艦は太字で示す。

一等潜水艦


二等潜水艦


三等潜水艦


特殊潜航艇


計画艦・実験艦